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操作说明
物种分类关系图
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物种分类关系图
操作说明

a)登录TUTU云平台(https://www.cloudtutu.com/#/login),点击登录;

b)默认账号密码已填好,输入验证码即可登录;

c)找到“物种分类关系图”进入作图界面。


1.说明

生物分类是研究生物的一种基本方法,物种分类关系图是常用来直观表现物种之间的对应关系的图形之一。以下的物种分类关系图实际上是桑基图的表现形式之一,它将桑基图展现能量分流的形式转化应用为反映物种分类信息的形式。


2.上传文件

※目前平台仅支持.txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件的文件上传。(平台可对不规范的数据格式进行部分处理,但还是请您尽量按照示例数据的格式调整数据,以便机器可以识别)

  a)准备一个数据矩阵(形式参照示例数据,如物种分类表);

  b)表格需要带表头和列名,每一列为指标数据名,例如某一物种的物种分类水平指标、丰度等等,每一行为物种名,例如OTU、ASV、基因ID、代谢名称等等;

  c)请提交txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件。操作方法为:全选excel中的所有内容(ctrl+A),复制到记事本中,将记事本文件另存后点击“上传”按钮上传该文件。


3.参数设置

  3.1 字体大小:按需自行设置


4.在线预览

点击“运行”开始作图,出图后可选择“动态预览”和“图片预览”两种方式进行图片查看。其中”动态预览“可以调节节点的位置,节点之间的阴影连线也会随之变动,效果如下。

                                 动态                                                                                                                    静态


5.下载文件

图片确认无误后可点击“下载”保存压缩包查看,其中包含PNG、PDF以及网页版文件(网页版也可以调节节点排版效果)。


6.作图后处理

TUTU云平台提供的PDF格式的矢量图,可通过矢量图处理软件进行编辑和调整(如:文字字体,文字大小,图片分辨率等)。图形处理软件和使用方法可扫描文后的二维码添加小编获取。


7.写作建议

Spearman/Pearson correlation by xxx abundance. Only significant values (p < 0.05/0.01 after FDR adjustment) are shown. Orange and blue colors (替换颜色) represent significant negative correlations and positive correlations. Darker color represents stronger correlations


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