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操作说明
时序分析
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时序分析
操作说明

a)登录TUTU云平台(https://www.cloudtutu.com/#/login),点击登录;

b)默认账号密码已填好,输入验证码即可登录;

c)找到“时序分析”进入作图界面。


1. 说明

时序分析是以分析时间序列的发展过程、方向和趋势,预测将来时域可能达到的目标的方法。此分析是运用概率统计中时间序列分析原理和技术,利用时序系统的数据相关性,建立相应的数学模型,描述系统的时序状态,以预测未来。(来自百度百科)

在转录组数据分析中,时序分析多用于分析不同基因随着时间点的动态变化的情况,特别是样本(属于同一种处理方式下)由于时间点的不同可能呈现出不同的生物学特征的情况下。


2. 上传文件

a) 准备两个数据矩阵(形式参照示例数据,如微生物物种丰度表、基因表达量矩阵、代谢物含量表,也可以是测量数据,例如身高、体重、表型等);

b) 表格需要带表头和列名,每一列为样本名,每一行为各种指标数据名,例如OTU基因ID、身高、代谢物名称等

c) 请提交txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件。操作方法为:全选excel中的所有内容(ctrl+A),复制到记事本中,将记事本文件另存后上传该文件。

示例数据

   分组文件示例数据

3. 参数设置

3.1 k值大小:k值选择大于9个请选择下载图片查看,窗口最多显示九张图

3.2 筛选显示种类:根据自己的需要,可以选择需要用的样品进行作图。

4. 下载文件

根据个人需求进行参数调整后点击运行,平台提供PDFPNG格式的文件以及表格文件下载。同时,还可以下载相关性系数矩阵表。相关性系数矩阵可用于后续其他分析。

5. 作图后处理

TUTU云平台提供的是PDF格式的矢量图,可通过矢量图处理软件进行编辑和调整(如:文字字体,文字大小,图片分辨率等)。图形处理软件和使用方法可扫描文后的二维码添加小编获取。

6. 写作建议

Spearman/Pearson correlation by xxx abundance. Only significant values (p < 0.05/0.01 after FDR adjustment) are shown. Orange and blue colors (替换颜色) represent significant negative correlations and positive correlations. Darker color represents stronger correlations.



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