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操作说明
ANOSIM组间差异分析
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ANOSIM组间差异分析
操作说明

a)登录TUTU云平台(https://www.cloudtutu.com/#/login)点此登录;

b)默认账号密码已填好,输入验证码即可登录;

c)找到“ANOSIM”进入作图界面。


1. 说明

ANOSIM分析(analysis ofsimilarities)即相似性分析,是一种基于置换检验和秩和检验的非参数检验方法,用来检验组间的差异是否显著大于组内差异,从而判断分组是否有意义。ANOSIM分析还可用于评估两组实验数据的整体相似性,以及相似性是否显著。在一些高维数据分析中,ANOSIM分析可以显示组间差异的现实性指标,弥补了PCA、PCoA、NMDS等方法在此方面的不足。

2. 上传文件

a) 准备一个数据矩阵(如微生物物种丰度表、基因表达量矩阵、代谢物含量表,也可以是测量数据,例如身高、体重、表型等);

b) 表格每一列为样本名,每一行为某指标具体数值;

c) 重要:请提交txt(制表符分隔)文本文件。操作方法为:全选excel中的所有内容(ctrl+A),复制到记事本中,将记事本文件另存后上传该文件。

3. 参数设置

3.1 分组信息:整个页面的右下角(图片的下方)

需要对所有样品进行分组,本网站支持在线修改分组名称和样品名称的功能。

3.2 筛选显示种类:根据自己的需要,可以选择需要用的样品进行作图。

4. 下载文件

根据个人需求进行参数调整后点击运行,平台提供PDFPNG格式的文件以及表格文件下载。同时,还可以下载相关性系数矩阵表。相关性系数矩阵可用于后续其他分析。

5. 作图后处理

TUTU云平台提供的是PDF格式的矢量图,可通过矢量图处理软件进行编辑和调整(如:文字字体,文字大小,图片分辨率等)。图形处理软件和使用方法可扫描文后的二维码添加小编获取。

6. 写作建议

Spearman/Pearson correlation by xxx abundance. Only significant values (p < 0.05/0.01 after FDR adjustment) are shown. Orange and blue colors (替换颜色) represent significant negative correlations and positive correlations. Darker color represents stronger correlations.


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