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操作说明
山脊图(Ridgeline chart)
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山脊图(Ridgeline chart)
操作说明

a)登录TUTU云平台(https://www.cloudtutu.com/#/login)点此登录;

b)默认账号密码已填好,输入验证码即可登录;

c)找到“山脊图Ridgeline chart)”进入作图界面。


1.说明

山脊图(Ridgeline chart)作为可视化图形的一种,可以研究不同群组的数值变量的分布情况,展示不同类别数据在同一因素的不同水平下的分布差异,分布可以用直方图和密度图表示,它们都对齐到相同的水平尺度,并以轻微的重叠来表示。


2. 上传文件

目前平台仅支持.txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件的文件上传。

平台可对不规范的数据格式进行部分处理,但还是请您尽量按照示例数据的格式调整数据,以便机器可以识别。

a) 准备一个数据矩阵(形式参照示例数据,如微生物物种丰度表、基因表达量矩阵、代谢物含量表,也可以是测量数据,例如身高、体重、表型等);

b) 表格每一列为样本名,每一行为具体数值;

c) 请提交txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件。操作方法为:全选excel中的所有内容(ctrl+A),复制到记事本中,将记事本文件另存后上传该文件。

3. 参数设置

3.1绘图类型选择常规、渐变

“常规”                                “渐变”

            

3.2 透明度:按需求自行设置

3.3 线条形状选择density_ridges、binline

“density_ridges”                   “binline”

          

3.4 自定义横坐标:按需求自行设置

3.5 自定义纵坐标:按需求自行设置

3.6筛选显示种类:按需自行选择要用的样本进行作图

4.下载文件

点击“运行”开始作图,点击“下载”保存PDF格式的矢量图。PDF格式的文件可通过矢量图编辑工具进行编辑。

5.作图后处理

TUTU云平台提供的是PDF格式的矢量图,可通过矢量图处理软件进行编辑和调整(如:文字字体,文字大小,图片分辨率等)。图形处理软件和使用方法可扫描文后的二维码添加小编获取。

6.写作建议

Spearman/Pearson correlation by xxx abundance. Only significant values (p < 0.05/0.01 after FDR adjustment) are shown. Orange and blue colors (替换颜色) represent significant negative correlations and positive correlations. Darker color represents stronger correlations

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