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操作说明
气泡图
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气泡图
操作说明

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c)找到“气泡图”进入作图界面。

1.说明

气泡图(bubble chart)形似气泡,是用于展示三个变量之间关系的数据统计分析图表之一,它最多能够实现同一个事物的四个维度的直观的数据可视化。气泡图横纵坐标各是一个变量,第三个变量用气泡的大小来表示,与此同时还可以加入一个表示大小的变量进行比对。在生信分析中,GO/KEGG功能注释和富集分析气泡图是比较常见的。

气泡.png

2. 上传文件

a)准备一个数据矩阵(形式参照示例数据,如微生物物种丰度表、基因表达量矩阵、代谢物含量表,也可以是测量数据,例如身高、体重、表型等);

b)表格需要带表头和列名,每一列为样本名,每一行为各种指标数据名,例如OTU,基因ID、身高、代谢物名称等。

c)请提交txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件。操作方法为:全选excel中的所有内容(ctrl+A),复制到记事本中,将记事本文件另存后上传该文件。

气泡 (1).png

3. 设置参数

3.1 自定义横坐标:按照需求自行设置

3.2 自定义纵坐标:按照需求自行设置

3.3 绘制数量:选取元素数量多少

3.4 颜色选择:按照需求自行设置

3.5 横坐标字体旋转:为图片美观旋转横坐标字体角度


4. 下载文件

点击“运行”开始作图,点击“下载”保存PDF格式的矢量图。PDF格式的文件可通过矢量图编辑工具进行编辑。


5.作图后处理

TUTU云平台提供的是PDF格式的矢量图,可通过矢量图处理软件进行编辑和调整(如:文字字体,文字大小,图片分辨率等)。图形处理软件和使用方法可扫描文后的二维码添加小编获取。


6. 写作建议

Spearman/Pearson correlation by xxx abundance. Only significant values (p < 0.05/0.01 after FDR adjustment) are shown. Orange and blue colors (替换颜色) represent significant negative correlations and positive correlations. Darker color represents stronger correlations


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