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操作说明
稀释曲线
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稀释曲线
操作说明

a)登录TUTU云平台(https://www.cloudtutu.com/#/login)点此登录;

b)默认账号密码已填好,输入验证码即可登录;

c)找到“稀释曲线”进入作图界面。

1.说明

稀释曲线(Rarefaction Curve,也称稀疏曲线):一般在微生物组研究中用于评估测序量或样本量的饱和情况。

quxian.png

2. 上传文件


a)文件第一列为指标ID名,第一行为样品或处理名称。

稀释曲线1.0.png

b)可直接提交csv文件或者提交txt(制表符分隔)文本文件。操作方法为:全选excel中的所有内容(ctrl+A),复制到记事本中,将记事本文件另存后上传该文件。

3. 设置参数


3.1可以根据需求对指数方法、作图类型、图片宽度和高度进行设置,设置好参数后点击运行按钮即可生成对应图片。

稀释曲线2.0.png

3.2   可点击筛选样品字样,对需要绘图的样品进行删选。



稀释曲线3.0.png



稀释曲线4.0.png稀释曲线5.0.png

选中后再次点击“运行”按钮即可生成所选中样品图片。

4. 下载文件

根据个人需求进行参数调整后点击运行,平台提供PDF和PNG格式的文件下载。


5. 作图后处理

TUTU云平台提供的是PDF格式的矢量图,可通过矢量图处理软件进行编辑和调整(如:文字字体,文字大小,图片分辨率等)。图形处理软件和使用方法可扫描文后的二维码添加小编获取。


6.写作建议

Spearman/Pearson correlation by xxx abundance. Only significant values (p < 0.05/0.01 after FDR adjustment) are shown. Orange and blue colors (替换颜色) represent significant negative correlations and positive correlations. Darker color represents stronger correlations.

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