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操作说明
Mantel   test相关性图
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Mantel   test相关性图
操作说明

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c)找到“Mantel   test相关性图”,进入画图界面。

1.说明

Mantel test分析对两个矩阵相关关系进行检验。Mantel test的相关性越大,p值越小,则说明环境因子对微生物群落的影响越大。不仅如此,它的偏分析(partial Mantel test)可以排除环境因子之间自相关的干扰。

2.上传文件

a)表格需要带表头和列名,每一列为所用关联分析数据的列名,每一行为每列对应各种指标数据名,例如:分类信息,样本名等。


123.png

b)环境因子文件a文件对应的环境因子数据。

1234.png

c)可直接提交csv文件或者提交txt(制表符分隔)文本文件。操作方法为:全选excel中的所有内容(ctrl+A),复制到记事本中,将记事本文件另存后上传该文件。

3.设置参数

3.1 可以根据自己需求对颜色,形状,标记等参数进行调整。

12345.png

3.2可根据需求对分组信息进行在线修改。

123456.png

4. 下载文件

根据个人需求进行参数调整后点击运行,平台提供PDF和PNG格式的文件下载。


5. 作图后处理

TUTU云平台提供的是PDF格式的矢量图,可通过矢量图处理软件进行编辑和调整(如:文字字体,文字大小,图片分辨率等)。图形处理软件和使用方法可扫描文后的二维码添加小编获取。


6.写作建议

Spearman/Pearson correlation by xxx abundance. Only significant values (p < 0.05/0.01 after FDR adjustment) are shown. Orange and blue colors (替换颜色) represent significant negative correlations and positive correlations. Darker color represents stronger correlations.




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