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操作说明
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变量相关图(PCA)
操作说明

a)登录TUTU云平台(https://www.cloudtutu.com/#/login)点此登录;

b)默认账号密码已填好,输入验证码即可登录;

c)找到“变量相关图(PCA)”进入作图界面。


1.说明

变量相关图(Variables - PCA)将PCA主成分分析与变量相结合,通过在同一坐标轴内展示主成分与变量之间的关系。表示正相关的变量在位置上会彼此靠近,反之,负相关的变量彼此距离会越远,从中心点到变量的长度代表着此变量在这个维度所占的比例。

2.上传文件

※目前平台仅支持.txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件的文件上传。(平台可对不规范的数据格式进行部分处理,但还是请您尽量按照示例数据的格式调整数据,以便机器可以识别)

a)准备一个数据矩阵(形式参照示例数据)

b)表格需要带表头和列名,每一行为样本名,每一列为各种指标数据名,例如OTU、基因ID等等;

c)请提交txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件。操作方法为:全选excel中的所有内容(ctrl+A),复制到记事本中,将记事本文件另存后点击“上传”按钮上传该文件。


3.参数设置

3.1 颜色选择:按需自行设置

3.2 val值选择:contrib、cos2


4.下载文件

点击“运行”开始作图,点击“下载”保存结果文件(包含Variables-PCA、PCA-Biplot图)。PDF格式的文件可通过矢量图编辑工具进行编辑。


5.作图后处理

TUTU云平台提供的是PDF格式的矢量图,可通过矢量图处理软件进行编辑和调整(如:文字字体,文字大小,图片分辨率等)。图形处理软件和使用方法可扫描文后的二维码添加小编获取。


6.写作建议

XXXX was performed on Tutools platform (https://www.cloudtutu.com), a free online data analysis website.







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