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操作说明
环装热图
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环装热图
操作说明

a)登录TUTU云平台(https://www.cloudtutu.com/#/login),点此登录;

b)默认账号密码已填好,输入验证码即可登录;

c)找到“环装热图”进入作图界面。


1.说明

热图因其丰富的色彩变化和生动饱满的信息表达被广泛应用于各种大数据分析场景。在组学相关的文章中,我们常常可以看到热图(Heatmap)的展示,热图作为一种对实验数据及其结果分析的直观表达方式,在很多文章中有着不可或缺的地位。在基因表达量热图中,每个小方格表示每个基因,其颜色表示基因表达量的大小,通常表达量越大,颜色越深。每行表示该基因在不同样本中的表达情况。环状热图也是热图的一种,适合多组或多组学的研究。


2.上传文件

※目前平台仅支持.txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件的文件上传(平台可对不规范的数据格式进行部分处理,但还是请您尽量按照示例数据的格式调整数据,以便机器可以识别)

a)准备一个数据矩阵(形式参照示例数据,如微生物物种丰度表、基因表达量矩阵、代谢物含量表,也可以是测量数据,例如身高、体重、表型等);

b)表格需要带表头和列名,每一列为样本名,每一行为各种指标数据名,例如OTU,基因ID、身高、代谢物名称等。

c)请提交txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件。操作方法为:全选excel中的所有内容(ctrl+A),复制到记事本中,将记事本文件另存后上传该文件。


3.参数设置

3.1 绘制数量:热图绘制的样本数量多少

3.2 颜色选择:按需自行选择

3.3 样本名字体大小:按需自行选择

3.4 基因名字体大小:按需自行选择

3.5 是否显示进化树:按需自行选择


4.下载文件

点击“运行”开始作图,点击“下载”保存PDF格式的矢量图。PDF格式的文件可通过矢量图编辑工具进行编辑。


5.作图后处理

TUTU云平台提供的是PDF格式的矢量图,可通过矢量图处理软件进行编辑和调整(如:文字字体,文字大小,图片分辨率等)。图形处理软件和使用方法可扫描文后的二维码添加“小图”获取。


6.写作建议

XXXX was performed on Tutools platform (https://www.cloudtutu.com), a free online data analysis website.





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